Nature:牙龈蛋白释放因子Wapl促进V基因重排的机制

2022-01-31 00:17:14 来源:
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蛋白质核内的一些生物学处理过程,比如V(D)J苯基,并不一定是由性染色体一维构象所催化反应,包括性染色体区室(compartments)、等价关的在结构上域(topologically associated domains, 亦称TADs)和体蛋白质一个环(chromatin loop)等。TADs是由体蛋白质一个环做成(chromatin-loop extrusion)所过渡到的,而这一处理过程举例来说圆一个环外观的粘连蛋白质核酸(cohesion complex)。与之相对于应的是,粘连蛋白质释放出来突变Wapl可以放宽体蛋白质一个环的伸展(loop extension),从而起着负向催化反应的发挥作用。

一系列病原体的产生,构成了体液免疫抵御外来病原体的主要成分,而病原体的多样性,是由V(D)J苯基所构建的,这一处理过程,举例来说Pax5所介导的2.8Mb短免疫球蛋白质重链(immunoglobulin hey chain,亦称lgh)底物的屈曲。然而在前所体B蛋白质(pre-B cells)里,Pax5是如何催化反应lgh屈曲的,仍旧不得而知。

近日,来自德国Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger科学研究组在Nature上发表篇文章Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的文章,说明Pax5通过可抑制Wapl,从而构建对lgh的催化反应。

因为体蛋白质一个环做成举例来说包覆连蛋白质核酸,所以,译者首先科学研究在前所体B蛋白质里,粘连蛋白质核酸各组分的表达究竟发生巨大变化。译者注意到,在RNA总体上,相较于其他一般而言的肝蛋白质,前所体B蛋白质和原B蛋白质(pro-B cell)的的Wapl总体持续上升了四倍。蛋白质总体也有近似于的注意到。这些结果只不过,包覆连蛋白质释放出来突变Wapl的持续上升,很有可能增加包覆连蛋白质在体蛋白质上的存留时间。

有报道指出,Pax5可以催化反应lgh底物屈曲,译者接下来概述,Pax5究竟可以负面影响Wapl在前所体B蛋白质里的表达。译者通过Pax5性状弱点大鼠注意到,缺失了Pax5的前所体B蛋白质,Wapl的mRNA总体增加了4~6倍。另外,前所体B蛋白质里,Wapl上不存在2个Pax5为基础底物P1和P2,而在成熟的B蛋白质里,为基础底物增加至1个(仅存P2)。这些结果明确指出,在前所体B蛋白质里,Pax5可以可抑制Wapl总体。

在P1敲除大鼠里,自体里的B蛋白质胚胎发育基本上返程在前所体B蛋白质收尾,这明确指出,B蛋白质胚胎发育是颇受Wapl上Pax5为基础底物P1所催化反应的。另外,通过VDJ化学合成,译者注意到,P1敲除的大鼠,前所体B蛋白质里VDJH的苯基比例孝着增加。而在Pax5敲除大鼠里,也或多或少注意到近似于的现象,并且,Pax5大鼠lgh底物未能顺利完成屈曲。这些结果明确指出,Wapl上的Pax5为基础底物P1可以抑止lgh体蛋白质一个环做成。

最后,译者关注Pax5对Wapl的可抑制,究竟亦会负面影响前所体B蛋白质整个性染色体的在结构上。译者注意到,只有在B蛋白质胚胎发育的早期收尾,Pax5可以负面影响包覆连蛋白质在体蛋白质上的驻留时间。并且,与正常的前所体B蛋白质相比,Pax5敲除大鼠的前所体蛋白质和P1,P2敲除的前所B蛋白质,其TADs里体蛋白质一个环的过渡到总体孝着增加;与此相对于的是,大片段的体蛋白质屈曲,从而过渡到性染色体有规律的总体,却大大升高。这些结果明确指出,在原B蛋白质里,Pax5的为基础底物P1所抑止的Wapl总体增加,孝着负面影响了整个蛋白质的性染色体在结构上。

综上所述,译者注意到,在前所体B蛋白质和原B蛋白质里,Pax5可以可抑制包覆连蛋白质释放出来突变Wapl的表达,从而延展包覆连蛋白质在体蛋白质上的驻留时间,进而促进体蛋白质一个环做成总体的升高。这一处理过程是通过Wapl上的Pax5为基础底物P1构建的。而且,Wapl表达总体的增加,可以引起性染色体在结构上的整体巨大变化,这也是前所体B蛋白质里发生高总体的V性状苯基的有可能原因之一。

在此之前,就在这篇NatureAPP后的隔日,先于印本bioRxiv上网络服务发布了来自哈佛大学Frederich Alt实验室篇文章“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的近似于临时工,或多或少证明Wapl通过负面影响体蛋白质一个环做成负面影响性状苯基的重要发挥作用。

原始出处:

Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.

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